La Cité des Jeunes est une association loi 1901, déclarée le 9 décembre 1946 (JO du 22/01/1947).

Elle possède un agrément « Jeunesse et Éducation Populaire » du Ministère de la jeunesse, des sports et de la vie associative (depuis le 30 août 1966, agrément n° 75 JEP 05-331 renouvelé le 27 juin 2005). Cet agrément signifie qu’elle s’engage à avoir un fonctionnement démocratique et à participer à la mission d’éducation citoyenne de l’État.

En tant qu’adhérent de la FACEL, la Cité des Jeunes est sous l’autorité de l’archevêque de Paris, qui garantit son appartenance à l’Église catholique. Elle est guidée par un aumônier qui forme les animateurs sur le plan théologique et spirituel.

La Cité des Jeunes adhère également à l’UFCV, fédération qui réunit dans un esprit laïc des associations d’identités diverses accueillant des jeunes.

La Cité des Jeunes est ouverte à tous, mais les familles et les participants doivent connaître et respecter son identité catholique. Ils sont invités à partager ses valeurs durant le temps du séjour, dans le respect des convictions de chacun.